Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EBAG9O00559 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EBAG9O00559 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms