Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MEIS1O00470 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MEIS1O00470 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms