Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PIK3CDO00329 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PIK3CDO00329 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms