Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GOLGA8SH3BPF8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA8SH3BPF8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms