Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRDCB7Z8K6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRDCB7Z8K6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms