Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTLL13PA6NNM8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL13PA6NNM8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms