Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GOLGA6L4A6NEF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms