Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PALM3A6NDB9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PALM3A6NDB9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms