Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF22A3QJZ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms