Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DENND3A2RUS2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND3A2RUS2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND3A2RUS2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND3A2RUS2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND3A2RUS2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND3A2RUS2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms