Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 FAM84A-202ENST00000331243 3765 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 ANKRD20A8P-201ENST00000432432 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
NICN1Q9BSH3 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MARK3-201ENST00000216288 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TAS1R2-201ENST00000375371 2542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC027020.2-201ENST00000602585 2389 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01429-201ENST00000438154 2326 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RNF17-202ENST00000255325 2134 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 COL9A1-202ENST00000357250 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01443-202ENST00000584531 1854 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BCAS1-201ENST00000371435 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CCNG1-201ENST00000340828 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KCNAB1-201ENST00000302490 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MORN4-203ENST00000478953 2225 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MYL1-202ENST00000352451 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL121574.1-201ENST00000415890 419 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IQCC-201ENST00000291358 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 S1PR3-201ENST00000358157 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ATAD5-201ENST00000321990 6869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CEP89-201ENST00000305768 5678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SLC12A3-201ENST00000262502 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IFT74-201ENST00000380062 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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