Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 IL1R2-202ENST00000393414 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 WDR78-201ENST00000371022 1520 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ALDOC-202ENST00000395319 1519 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ARSG-202ENST00000452479 1733 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AF131215.4-201ENST00000526648 1741 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 KRTAP19-4-201ENST00000334058 310 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 Z93242.2-201ENST00000445666 394 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 TIMM23B-202ENST00000451577 1152 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MYLK-AS1-203ENST00000485162 587 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SLC16A14P1-201ENST00000506846 1117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 C12orf80-202ENST00000551894 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC00663-207ENST00000590092 1023 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CTBP2P7-201ENST00000593270 1244 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC010326.4-202ENST00000603829 541 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 DNAJB14-212ENST00000610281 339 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC012486.1-201ENST00000625143 216 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CEP57-210ENST00000538658 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Q9Y3F1 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 ZNF772-209ENST00000615214 1506 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 LRRC2-201ENST00000296144 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 C17orf64-201ENST00000269127 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 CCL26-202ENST00000394905 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 LINC01135-201ENST00000419531 996 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 LINC02105-201ENST00000504552 1003 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 POU5F1-205ENST00000512818 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AC096713.1-201ENST00000514650 978 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 FAXDC2-205ENST00000517938 1203 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AP001922.3-201ENST00000524768 842 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 RN7SL238P-201ENST00000613832 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 AC105020.5-201ENST00000614810 423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.139-201ENST00000616096 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Q9Y3F1 RN7SL106P-201ENST00000618104 290 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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