Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPS6KL1Q9Y6S9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS6KL1Q9Y6S9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms