Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNMT3AQ9Y6K1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3AQ9Y6K1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms