Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD54BQ9Y620 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD54BQ9Y620 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms