Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAI2Q9Y5P3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAI2Q9Y5P3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms