Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSAG2Q9Y5P2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSAG2Q9Y5P2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms