Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PHLDA3Q9Y5J5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHLDA3Q9Y5J5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms