Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDHB12Q9Y5F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB12Q9Y5F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms