Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PAXBP1Q9Y5B6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAXBP1Q9Y5B6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms