Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
DCAF1Q9Y4B6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
DCAF1Q9Y4B6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC42.51■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
DCAF1Q9Y4B6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
DCAF1Q9Y4B6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms