Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RAD54L2Q9Y4B4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
RAD54L2Q9Y4B4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.88■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
RAD54L2Q9Y4B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RAD54L2Q9Y4B4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms