Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SIT1Q9Y3P8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SIT1Q9Y3P8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms