Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX24Q9Y343 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX24Q9Y343 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms