Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP20Q9Y2K6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP20Q9Y2K6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms