Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC9A8Q9Y2E8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC9A8Q9Y2E8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms