Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCML2Q9UQR0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCML2Q9UQR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SCML2Q9UQR0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms