Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP2BQ9UQN3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2BQ9UQN3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms