Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGSF9BQ9UPX0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGSF9BQ9UPX0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms