Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMG5Q9UPR3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMG5Q9UPR3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms