Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PDZRN3Q9UPQ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDZRN3Q9UPQ7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDZRN3Q9UPQ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms