Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PNMA3Q9UL41 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA3Q9UL41 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA3Q9UL41 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms