Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PARP4Q9UKK3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms