Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCAN3Q9UKA8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms