Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GGA2Q9UJY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA2Q9UJY4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms