Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HACL1Q9UJ83 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACL1Q9UJ83 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACL1Q9UJ83 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms