Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX25Q9UHL0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX25Q9UHL0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX25Q9UHL0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms