Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX20Q9UHI6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX20Q9UHI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms