Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MLH3Q9UHC1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
MLH3Q9UHC1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MLH3Q9UHC1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms