Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FBXO40Q9UH90 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FBXO40Q9UH90 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FBXO40Q9UH90 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms