Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNG4Q9UBN1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNG4Q9UBN1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms