Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRP2BPQ9P2M1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRP2BPQ9P2M1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms