Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHD7Q9P2D1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHD7Q9P2D1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms