Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD3Q9NYL9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
TMOD3Q9NYL9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD3Q9NYL9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms