Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDND1Q9NY35 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDND1Q9NY35 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms