Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FBXO28Q9NVF7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FBXO28Q9NVF7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO28Q9NVF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms