Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD4Q9NVD3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD4Q9NVD3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD4Q9NVD3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms