Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPTLC3Q9NUV7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPTLC3Q9NUV7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms