Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC39A9Q9NUM3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A9Q9NUM3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms