Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPMQ9NSP4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPMQ9NSP4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms